אוניברסיטת אילינויס בשיקאגו והמרכז לאנליזות גנומיות בנורוויץ' בריטניה, ממנפים מחשביSGI UV להאצת גילוי תרופות ואנליזות של בעיות מסובכות
SGI - חברת המחשוב הטכני המיוצגת בישראל ע"י חברת TNN תקשורת מקבוצת רפק הבורסאית, הודיעה כי חוקרים בתחום עתיר המחשוב של מחקר ביוטכנולוגיה, ממשיכים בהתקדמות פורצת דרך עם הבחירה במערכת HPC (מחשוב עתיר ביצועים) SGI UV.
ישראל וינמן, מנהל פעילות SGI ב- TNN תקשורת, אומר כי SGI UV הנה ארכיטקטורת זיכרון משותף סקלאבילית המאפשרת להתמודד עם אתגרי המחשוב המסובכים והמורכבים ביותר כיום.
המרכז לביוטכנולוגיה תרופתית באוניברסיטת אילינויס בשיקאגו (UIC) והמרכז לאנליזות גנומיות (TGAC) בבריטניה הם שתי דוגמאות לכך.
חוקרים במרכז לביוטכנולוגיה תרופתית ב- UIC עובדים על פיתוח אמצעי ריפוי חדשים הממוקדים במחלות מדבקות.
הגילוי של רכיבים כימיים חדשניים היוצרים את הבסיס עבור הפיתוח של מבנים מולקולריים של אנטי-מיקרוביאלים חדשים, הנו משימה מפרכת.
"חוקרים במרכז השתמשו בעשור הקודם באשכולות מבוססי SGI IRIX OS, ועכשיו עברו אל פתרון מחשוב עתיר ביצועים SGI UV המופעל ע"י מערכים גדולים של מעבדי Intel Xeon ו- GPUs של NVIDIA Tesla", אמר מיכאל ג'ונסון, פרופסור ומנהל אמריטוס במרכז לביוטכנולוגיה תרופתית ב- UIC. "אשכולות אלה מספקים גמישות מחשובית בניהול חישובים טוריים ומקביליים, והתאימות קדימה של מערכות SGI אפשרה לנו לפתח ולהרחיב בשקיפות את עוצמת המחשוב שלנו לאורך השנים, ולעמוד במורכבות הגדלה של הבעיות בהן אנו צריכים לטפל".
בבריטניה מתמחה המרכז לאנליזות גנומיות (TGAC) בגנומיקה וביו-אינפורמטיקה, עם מיקוד בניתוח ופרשנות של גנומים מהצומח, החי והמיקרוביאלי.
צוות ה- TGAC הושק ב- 2009, גדל ליותר מ- 50 חברים, כשמחצית מצוות המוסד עובד עם יכולות ביו-אינפורמטיקה לפרשנות, הרכבה ואנליזה של מערכי נתונים הנוצרים מרצפים המאוחסנים במעבדה שלהם.
"בחרנו ב- SGI UV בזכות הביצועים ויכולת ההתרחבות המעולים של המוצר, המשקפים את תמיכת החברה וניסיונה בקצה העליון של מחשוב עתיר ביצועים", אמר פול פרטאר, מנהל צוות מחשוב מדעי. "היתרון העיקרי של שימוש במערכת כזאת הנו היכולת להרכיב ולנתח רצפים גנומיים גדולים ביותר ומורכבים, עם מיליארד רצפים בזיכרון".
"משפחתSGI UV הופכת במהירות לסטנדרט דה פקטו של התעשייה עבור לקוחות המתמודדים עם אחדים מאתגרי Big Data המסובכים ביותר בעולם בתחום מדעי החיים", אומר ישראל וינמן, מנהל פעילות SGI בישראל. "הגיוון, הגמישות והסקלאביליות של מערכת UV הם שהפכו את המערכת לפתרון מחשוב ואחסון מושלם עבור אתגרים עתירי נתונים אלה".
